巴拿馬運河管理局局長巴斯克斯于1月8日表示，為美國船只提供運河通行費優惠將違反國際條約中對運河中立性的規定，可能引發混亂。在接受《華爾街日報》采訪時，巴斯克斯強調，運河管理局對美國船只的收費并不比其他國家船只高。對于美國候任總統特朗普提出的為美國船只提供通行費優惠的要求，巴斯克斯明確表示，“規則就是規則，沒有例外”，任何破壞中立性的政策都可能引發法律爭議。

針對特朗普關于“中國控制巴拿馬運河”的言論，巴斯克斯澄清說，中國并未參與巴拿馬運河的運營管理。該運河的運營管理工作由巴拿馬運河管理局負責。自當選以來，特朗普多次提出要重新掌控巴拿馬運河，并聲稱出于對美國“經濟安全需要”的考慮，他不會排除通過“軍事或經濟脅迫”手段奪取巴拿馬運河和格陵蘭島控制權的可能性。

對此，巴拿馬總統何塞·勞爾·穆利諾在1月7日表示，在1月20日美國當選總統特朗普就職典禮之前，他不會對“武力奪取巴拿馬運河”的威脅作出回應。目前，穆利諾曾聲明，巴拿馬運河主權屬于巴拿馬，不存在重新談判的空間。巴拿馬運河如今由巴拿馬人自主管理，通行費標準制定程序公開透明，不會給美國船只單獨降價。

巴拿馬外長馬丁內斯-阿查也重申了巴方立場，指出巴拿馬政府尚未與美國當選總統特朗普或其代表進行任何接觸，并再次強調巴拿馬運河主權不容談判。馬丁內斯-阿查表示，巴拿馬運河主權是巴拿馬人民斗爭史的一部分，是不可逆轉的勝利成果。巴方期待與特朗普政府維持合作關系，但“唯一掌控運河的是巴拿馬人的手”。對于特朗普關于不排除軍事手段奪取巴拿馬運河控制權的言論，馬丁內斯-阿查回應稱，巴拿馬政府將在特朗普正式就職后依據事態發展作出必要決策。